Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA4Q96DD7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms