Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAF2Q96CS3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAF2Q96CS3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms