Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX21Q969T3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX21Q969T3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX21Q969T3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms