Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1Q969G3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMARCE1Q969G3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms