Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
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PTPRUQ92729 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRUQ92729 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
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PTPRUQ92729 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
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PTPRUQ92729 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
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PTPRUQ92729 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
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PTPRUQ92729 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
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PTPRUQ92729 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
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PTPRUQ92729 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRUQ92729 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRUQ92729 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
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