Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CSRNP3Q8WYN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CSRNP3Q8WYN3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms