Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms