Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCAF4Q8WV16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms