Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM3Q8NE01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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