Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF38AQ8NAV1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF38AQ8NAV1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF38AQ8NAV1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms