Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM71DQ8N9W8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM71DQ8N9W8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71DQ8N9W8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71DQ8N9W8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM71DQ8N9W8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms