Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms