Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSL3Q8N5Y2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3Q8N5Y2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms