Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC71Q8N4P6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC71Q8N4P6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms