Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms