Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC50Q8IVM0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms