Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR49Q8IV35 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR49Q8IV35 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR49Q8IV35 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms