Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG1Q86XK7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSIG1Q86XK7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG1Q86XK7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms