Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT2Q7L5N7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms