Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms