Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC2Q6ZN30 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC2Q6ZN30 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNC2Q6ZN30 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms