Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC171Q6TFL3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC171Q6TFL3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms