Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LARP1Q6PKG0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP1Q6PKG0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms