Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms