Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCSAPQ6IQ19 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSAPQ6IQ19 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCSAPQ6IQ19 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
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