Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCAPH2Q6IBW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCAPH2Q6IBW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPH2Q6IBW4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms