Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC102BQ68D86 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms