Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CLQ60I27 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms