Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf57Q5W0N0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf57Q5W0N0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf57Q5W0N0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms