Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
C9orf84Q5VXU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
C9orf84Q5VXU9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
C9orf84Q5VXU9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms