Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM46CQ5VWP2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms