Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIF1Q5UIP0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms