Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOGA3Q5TF21 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SOGA3Q5TF21 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms