Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RSPH4AQ5TD94 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RSPH4AQ5TD94 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms