Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9C2Q5TAH2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9C2Q5TAH2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms