Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LDLRAD1Q5T700 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDLRAD1Q5T700 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDLRAD1Q5T700 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms