Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BEND3Q5T5X7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms