Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF678Q5SXM1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF678Q5SXM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.8 ms