Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PERM1Q5SV97 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms