Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD39Q53RE8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms