Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CEP55Q53EZ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP55Q53EZ4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP55Q53EZ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms