Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKDCCQ504Y2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKDCCQ504Y2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms