Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF3Q496Y0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF3Q496Y0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms