Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PROX2Q3B8N5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PROX2Q3B8N5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms