Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P3H1Q32P28 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P3H1Q32P28 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms