Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UVSSAQ2YD98 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UVSSAQ2YD98 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UVSSAQ2YD98 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms