Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VWC2Q2TAL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VWC2Q2TAL6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms