Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TXNRD1Q16881 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TXNRD1Q16881 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TXNRD1Q16881 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms