Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSRP2Q16527 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP2Q16527 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP2Q16527 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms