Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRIK5Q16478 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK5Q16478 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK5Q16478 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms